El CADIME tiene entre sus prioridades establecer un marco de colaboración con diferentes instituciones y grupos de profesionales sanitarios que aporten valor a los servicios ofrecidos. Entre estas destacan:

• Colaboración con la Comisión Asesora de Calidad y Eficiencia de la Prestación Farmacéutica Ambulatoria del SSPA.
• Colaboración con otros centros de información de medicamentos. La evaluación de nuevos medicamentos que realiza CADIME se hace de forma coordinada con los comités homólogos de Aragón, Castilla y León, Cataluña, Navarra y País Vasco. Estos comités forman el Comité Mixto de Evaluación de Nuevos Medicamentos (CmENM).